孕牛流感的治疗发现病牛要立即隔离治疗，但要正确处理发烧，因为发烧有抵御病毒繁殖和对抗病毒危害牛体的作用，这对牛是一种保护性反应，应受到保护，不要随意乱用抗菌素、磺胺类和其他消炎药，如牛精神尚好，病症较轻，仅有打喷嚏、流涕及轻咳时，只要用些脱敏药物，如异丙嗪，每次25毫克，或苯海拉明，每次50毫克，克服过敏，再注射10%维生素C10毫克~20毫克，每日一次，连用3日。最好配合针灸，针刺太阳、耳尖、山根、鼻梁、眼灵、尾尖、百会等穴位，再用葱须胡子250克、生姜200克、大萝卜300克、大蒜150克、橘子皮，水煎温服几剂就行了，一般多在3天~5天内都能很快自愈。但要抓好病牛的护理，注意保温，充分休息，多饮温水，治疗及时，则痊愈率高。但发烧时间过久，温度过高，可使体内营养物质及氧的消耗增加，并造成严重的代谢障碍，高烧还使牛抽搐，对牛不利，应适当降温，在高烧不退时可配合采用冷敷或用烧酒擦浴。体温能维持在40℃就行了。操之过急反而欲速不达。如果是流感，牛出现高热，剧烈咳嗽，寒战发抖，呼吸加快等重病症，须及早隔离，不失时机地抓紧治疗，用药愈早效果愈好。我们在治疗牛流感过程中，多采用中西医结合和选择有抗病毒作用的药物治疗，收到较好的效果。

主要用吗啉胍（ABAB），又叫吗啉双胍或病毒灵，对流感病毒有较好的抑制作用。盐酸吗啉胍片用量为1克~1.25克，拌料喂，每天3次，连用3日；也可用克毒金刚拌料喂或加入水中饮用，每牛每次1000毫克，每日两次，连用3天~5天；也可配合中药贯众500克，加水煎服，每天一剂，也有较好的治疗效果。
　　牛发烧也可用能解热镇痛和有消炎作用的水杨酸钠片，每次15克，加水灌服，每日两次。可不必用西医消炎药。
　　如果孕牛后期用链霉素，会产下耳聋的犊牛；如果用氯霉素，会在胎儿体内积聚，产下的犊牛呼吸不全，发绀，腹胀或造血功能抑制；若用磺胺类药物，在胎儿体内积聚后，会发生黄疸等。显然，这些消炎药物虽然能控制和消除感染，有利于牛的健康，但有较大的副作用，无论对孕牛对胎儿都不利。所以，用西药要选用副作用小的药物或中药。因为中药的清热解毒药也有一定的消炎作用，而且对胎儿没有副作用，能控制炎症，较为安全。
　　用中药治疗牛流感或控制感染，我们多用100%板蓝根注射液，肌肉注射30毫升~50毫升，每日两次，连用3天~5天；也可用贯众500克煎服，每天一剂，灌服两次，连用3天~5天；或金银花、连翘、茯苓、柴胡、牛蒡子、陈皮、甘草各100克，水煎服。
　　治疗牛发烧，用中药效果好，但要辨证，一般分风热感冒和风寒感冒两种。风热感冒应以凉性药治；风寒感冒则用温性药治。如吃药不对症，不仅感冒治不好，反而有害或加重病情。
　　流感病牛咳嗽重时，可用天门冬注射液治疗，用天门冬250克，桔梗125克，麻黄、半夏各62克。制法是把以上药物加水2.5千克，煎成1.5千克，过滤后分装，灭菌，每毫升相当于生药0.29克，具有止咳定喘功效，肌肉注射，每日一次。干咳时，用麻黄120克，地龙60克、蜂蜜120克，共研细末，开水冲调，温水一次灌服，每日一剂，疗效显著。发现牛瘸时，可用消炎痛片，700毫克~1000毫克；牛粪发干时，可加入人工盐100克；牛拉稀时，可加喂次硝酸铋20克~30克；病牛停食或牛体虚弱时加葡萄糖200克；心脏衰弱时，可用20%葡萄糖溶液1500毫升~2500毫升，静脉滴注，以补充速效能源，强心保肝和解毒；如食欲不佳，可用地塞米松，有增进食欲，调节新陈代谢，抗炎、抗过敏等作用，每次用90毫克，有促进牛流感恢复和防止感染继发症的好效果。